Plateforme intégrée pour l'ingénierie des génomes

 

Sébastien Rodrigue

Université de Sherbrooke

 

Domaine : organismes vivants

Programme : projet de recherche en équipe

Concours 2017-2018

La biologie synthétique amorce une nouvelle ère pendant laquelle des génomes entiers seront les sujets d'efforts de réingénierie importants. Nous proposons un projet innovateur et multidisciplinaire visant à développer une plateforme intégrée pour l'ingénierie de microorganismes. Cette plateforme comprend: 1) un outil de modélisation cellulaire performant, 2) des nouvelles méthodes efficaces et abordables de modification et de transplantation de génome et 3) une plateforme automatisée pour l'évolution accélérée de populations de cellules.

Bien que les outils développés peuvent en principe s'appliquer à pratiquement n'importe quel organisme, nous proposons d'abord d'utiliser et de valider chacun de ces outils dans l'étude de génomes minimaux basés sur la bactérie Mesoplasma florum. Nous souhaitons ainsi construire des génomes réduits afin d'acquérir de nouvelles connaissances fondamentales sur les règles régissant l'organisation et la plasticité des génomes ainsi que sur les mécanismes à la base du fonctionnement des cellules.