Croissance de Legionella pneumophila dans les systèmes hydriques : comprendre la relation entre son génome et le microbiome

 

Sébastien Faucher

Université McGill

 

Domaine : organismes vivants

Programme projet de recherche en équipe

Concours 2015-2016

Les légionelloses, comme la maladie du légionnaire, sont causées par la bactérie Legionella pneumophila (Lp). Les épidémies de légionelloses sont habituellement causées par une tour de refroidissement très contaminée par Lp, qui produit des aérosols qui transmettent Lp à l'humain. Dans les tours, Lp se multiplie à l'intérieur des amibes du microbiome. L'influence précise du microbiome de la tour sur la croissance de Lp est actuellement inconnue mais
il semble que certaines espèces favorisent la présence de Lp. D'un autre côté, certaines souches de Lp semblent être mieux adaptées à la croissance dans les tours que d'autres.

Notre hypothèse est qu'il existe une relation entre le microbiome des tours et la présence de certains gènes dans les souches les mieux adaptées. Nos objectifs sont donc de 1) déterminer quel profil de microbiome est associé à une croissance de Lp dans les tours et 2) d'identifier des gènes de Lp associés à la croissance en présence du microbiome. Pour
ce faire, nous collecterons des échantillons de microbiome d'une vingtaine de tours et nous évaluerons la capacité de croissance d'une vingtaine de souches dans ces microbiomes. Nous établirons par la suite l'identité de chaque microbiome par séquençage et les génomes des souches de Lp testées seront séquencés. Nous chercherons ensuite des corrélations entre le niveau de croissance, la présence de certaines espèces microbiennes (amibes, bactéries) dans les microbiomes et le contenu génétique des souches de Lp.

Cette étude devrait permettre d'identifier des marqueurs biologiques et des marqueurs génétiques pour identifier les tours renfermant des conditions optimales pour la croissance de Lp et de mieux prévenir les éclosions de légionelloses dans le cadre de la nouvelle réglementation sur les tours de refroidissement du Québec.